MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 5602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013124	GCC	2	6	814031	814036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_013124	GGC	2	6	814037	814042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_013124	GGT	2	6	814082	814087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_013124	CCT	2	6	814138	814143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_013124	GCT	2	6	815443	815448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_013124	GGC	2	6	815449	815454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_013124	CGA	3	9	820486	820494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_013124	GC	3	6	820499	820504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_013124	TGC	2	6	820558	820563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_013124	CG	3	6	820628	820633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_013124	GGT	2	6	820670	820675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_013124	TCG	2	6	820693	820698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_013124	CTC	2	6	820699	820704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_013124	TC	3	6	820703	820708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_013124	GATC	2	8	820729	820736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_013124	G	7	7	820800	820806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_013124	ACG	2	6	820843	820848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_013124	CGG	2	6	820895	820900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_013124	GTGCGG	2	12	820916	820927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2020	NC_013124	GGA	2	6	820940	820945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_013124	GTG	2	6	821641	821646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_013124	TGG	2	6	821790	821795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_013124	C	6	6	821815	821820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2024	NC_013124	GAG	2	6	821828	821833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_013124	GGAG	2	8	821854	821861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_013124	TCC	2	6	821900	821905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2027	NC_013124	TCGC	2	8	821958	821965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2030	NC_013124	TGG	2	6	822086	822091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_013124	GAG	2	6	822121	822126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_013124	CGGG	2	8	822231	822238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2033	NC_013124	GCT	2	6	822283	822288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_013124	AGCG	2	8	822320	822327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2035	NC_013124	TCGAC	2	10	822433	822442	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2036	NC_013124	G	6	6	824522	824527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_013124	GAGGG	2	10	829751	829760	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_013124	CG	3	6	835774	835779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_013124	CTC	2	6	839376	839381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_013124	GTC	2	6	842893	842898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_013124	GCG	2	6	842936	842941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_013124	GGT	2	6	842974	842979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_013124	GCGG	2	8	843005	843012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2044	NC_013124	TCG	3	9	845136	845144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_013124	GAG	2	6	845173	845178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_013124	CGA	2	6	850327	850332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_013124	GAC	2	6	850340	850345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_013124	TGA	2	6	850354	850359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_013124	GC	3	6	850364	850369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_013124	C	6	6	850428	850433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2051	NC_013124	GAG	2	6	850496	850501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_013124	TGC	2	6	851807	851812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_013124	G	6	6	851843	851848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_013124	ACC	2	6	851874	851879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_013124	GC	3	6	851924	851929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_013124	CCA	2	6	851992	851997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_013124	GC	3	6	851999	852004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2058	NC_013124	GAA	2	6	852041	852046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_013124	CGT	2	6	852112	852117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_013124	GTC	2	6	852137	852142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_013124	GCC	2	6	852172	852177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_013124	CCA	2	6	852185	852190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2063	NC_013124	GTG	2	6	852191	852196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_013124	ACG	2	6	852240	852245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_013124	GCG	2	6	852246	852251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_013124	ATCGC	2	10	854073	854082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2067	NC_013124	TCT	2	6	855633	855638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_013124	CCG	2	6	855654	855659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2069	NC_013124	GAC	2	6	855688	855693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_013124	TGC	2	6	855710	855715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_013124	CGT	2	6	855719	855724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_013124	G	6	6	855730	855735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_013124	GCG	2	6	855744	855749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2074	NC_013124	CGG	2	6	856060	856065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_013124	CGG	2	6	856087	856092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_013124	TG	3	6	856169	856174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_013124	CG	3	6	878569	878574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2110	NC_013124	G	6	6	878588	878593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_013124	TGGGC	2	10	878743	878752	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2113	NC_013124	GC	3	6	878844	878849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2117	NC_013124	TGA	2	6	878938	878943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2119	NC_013124	GCC	2	6	879007	879012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2122	NC_013124	CG	3	6	879222	879227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2123	NC_013124	TG	3	6	879230	879235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_013124	ACG	2	6	879262	879267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2126	NC_013124	CGC	2	6	879329	879334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2127	NC_013124	GCA	2	6	879346	879351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_013124	CG	3	6	879375	879380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2129	NC_013124	TCTAG	2	10	880382	880391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2130	NC_013124	GTC	2	6	880392	880397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_013124	GGAGT	2	10	880467	880476	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_013124	GGT	2	6	880488	880493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_013124	TCG	2	6	880544	880549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_013124	CGA	2	6	880571	880576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2136	NC_013124	CGA	2	6	881259	881264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2235	NC_013124	TGC	2	6	934564	934569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2254	NC_013124	TC	3	6	945274	945279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2255	NC_013124	AG	3	6	945283	945288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_013124	CG	3	6	945311	945316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2261	NC_013124	TCG	2	6	945561	945566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_013124	CCT	2	6	945634	945639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2263	NC_013124	CG	3	6	945646	945651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2264	NC_013124	GTCG	2	8	945721	945728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2265	NC_013124	TCG	2	6	945804	945809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2267	NC_013124	GCT	2	6	945855	945860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2269	NC_013124	CGGCG	2	10	945933	945942	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2304	NC_013124	GAG	2	6	949479	949484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2379	NC_013124	CG	4	8	953897	953904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_013124	GGTCGC	2	12	953996	954007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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2388	NC_013124	CGT	2	6	954248	954253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2389	NC_013124	TCG	2	6	954268	954273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2390	NC_013124	GTC	2	6	954279	954284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2391	NC_013124	CGGA	2	8	954296	954303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2392	NC_013124	CGT	2	6	954333	954338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2394	NC_013124	CAG	2	6	954411	954416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2397	NC_013124	GAA	2	6	954512	954517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_013124	GCGTC	2	10	954532	954541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2399	NC_013124	GCGA	2	8	954552	954559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2400	NC_013124	GCG	2	6	954620	954625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2401	NC_013124	TCG	2	6	954634	954639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2402	NC_013124	CGA	2	6	954655	954660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_013124	CGA	3	9	954665	954673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2404	NC_013124	AGC	2	6	954704	954709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2405	NC_013124	TCG	2	6	954743	954748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2407	NC_013124	CA	3	6	955883	955888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2408	NC_013124	CAC	2	6	956395	956400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2409	NC_013124	GC	3	6	959165	959170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2410	NC_013124	TG	3	6	959185	959190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2433	NC_013124	CGG	2	6	983539	983544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2437	NC_013124	CG	3	6	983987	983992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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